Scully

在电影FTF里出现的变种alien从一个基因技术研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案现在由Spender和Fowley主管。Gibson最后又不见了。

对Jeremiah Smith的持续搜索导致Scully发现了加密的数据文件，这些文件的目的还不清楚。杰里米被一个不为人知的刺客紧紧地追捕，带着穆德到加拿大农村一个偏僻的农场，而穿西装的男人决定了穆德夫人的命运。

Mulder在医院被Fowley监管着。他想办法请来了Skinner和Kritschgau来帮忙，他们了解到Mulder拥有了CIA一直在研究的读心术。Scully在象牙海岸寻找治愈Mulder的办法。Mulder的病情加重了。

FOX正式宣布复活《X档案》。新版剧集将以6集迷你剧形式展开，原剧中的DavidDuchovny和GillianAnderson均会回归，重现角色FoxMulder和DanaScully。